‘Wij hadden niet verwacht dat we dit in ons wetenschappelijk leven nog zouden zien’

AF-Q5TC12-F1 (3)

Beeld: AlphaFold

Science en Nature beschouwen eiwitvouwing voorspellen met kunstmatige intelligentie als dé wetenschappelijke doorbraak van 2021. Wij spraken twee experts over de kansen en beperkingen van deze ‘gigantische stap vooruit’.

Op een dag zal het mogelijk zijn om de driedimensionale structuur van een eiwit te voorspellen enkel en alleen op basis van de aminozuurvolgorde, zo voorspelde biochemicus en eiwitstructuur-expert Christian Anfinsen in zijn dankrede voor de Nobelprijs van 1972. Bijna vijftig jaar later is het zover: ontwikkelaars slaagden er vorig jaar middels artificiële intelligentie (AI) in om eiwitvouwing bijna perfect te voorspellen.

Bepaling van eiwitstructuren vergde voorheen arbeidsintensieve analyses in het lab. Alles veranderde in juli 2021, toen het Google DeepMind-team hun AlphaFold-methode publiceerde in Nature. Kort daarna volgde het Baker-laboratorium van de University of Washington (Seattle) met hun vergelijkbare methode RoseTTAfold in Science. Beide methodes gebruiken een deep learning algoritme en kunnen relatief snel en gemakkelijk eiwitstructuren berekenen. Het DeepMind-team paste AlphaFold inmiddels toe op enkele volledige genomen, waaronder dat van de mens. Ze voorspelden de structuur van bijna elk eiwit in het menselijk lichaam en de vrijwel complete proteomen van twintig andere organismen, waaronder de muis, de fruitvlieg en bakkersgist (Saccharomyces cerevisiae).

 

0098-Mockup-KNCV_Betaalhekje_412x374

Verder lezen?
Maak eenvoudig een gratis profiel aan.

  • krijg toegang tot ons online archief met meer dan 10.000 artikelen over chemie, life sciences en procestechnologie;
  • kijk webinars live mee of later terug, lees exclusieve online-only content en plaats reacties op artikelen;
  • ontvang elke week onze nieuwsbrief C2Weekly in je mailbox met nieuws en ontwikkelingen zodat je altijd up-to-date bent.

Als lid van de KNCVKVCVNBV, of NVBMB  heeft u onbeperkt toegang tot deze site, u kunt hier inloggen.

0098-Mockup-KNCV_Betaalhekje_Logo-balk