Webdatabase voor eiwitten gelanceerd

Een onderzoeker van Johns Hopkins Institute of Genetic Medicine heeft een openbare database voor humane eiwitten in elkaar geklust. In deze database kunnen onderzoeker hun eigen eiwitinformatie aanleveren, eventueel met verwijzingen naar hun publicatie.

De database bevat nu gegevens over meer dan 15.000 eiwitten uit 71 laboratoria, zo meldt initiatiefnemer Akhilesh Pandey in Nature Biotechnology. In de database is bijvoorbeeld te vinden welke modificaties eiwitten ondergaan nadat ze in de cel gesynthetiseerd zijn, welke eiwit-eiwitinteracties er plaatst vinden, welke eiwitten tot expressie komen in bepaalde cellijnen, en welk enzym welk substraat kan omzetten.

Pandey hoopt dat deze database het eiwitonderzoek vooruit zal helpen. “Onderzoekers kunnen er snel achter komen wat er al bekend is van het eiwit waar ze aan werken, wat hun onderzoek weer versnelt.” Hij hoopt nog op medewerking van Google en Microsoft om de database geavanceerder te maken.

Bron: Science Daily