Fouten in bio-informaticaprogramma’s verholpen

Met nieuwe trucs hebben onderzoekers van het bio-informatica-instituut van het European Molecular Biology Laboratory (EMBL) sequentieprogramma’s verbeterd.

De onderzoekers ontdekten dat methodes om gensequenties af te zoeken fouten bevatten. Deze onderzoeksmethodes zijn bedoeld om verwantschap tussen verschillende soorten te onderzoeken. De onderzoekers hebben nu een nieuwe rekenmethode ontwikkeld om die fouten te voorkomen, melden ze in Science.

De huidige methodes houden te weinig rekening met een insertie of deletie van basen in het DNA.
De nieuwe manier van genen tellen vergelijkt eerst verschillende tussen bijvoorbeeld mens en chimpansee. Mochten er verschillen optreden, dan vergelijkt de database het DNA van chimpansees met andere apensoorten, zoals gorilla’s. Ontbreekt hier dezelfde base, dan kan dat komen door een deletie.

Met de nieuwe techniek kunnen veel inserties worden opgevist. Deleties blijken minder vaak voor te komen dan tot nu toe gedacht.

Bron: EMBL