Invloed mutaties op genetische expressie hangt sterk af van celtype

Om te ontdekken hoe bepaalde delen van het DNA de expressie van genen elders in dat DNA regelen, moet je je proeven overdoen met zo veel mogelijk verschillende celtypen. Anders is de kans groot dat je jezelf voor de gek houdt, zo suggereren Groningse onderzoekers in PLoS Genetics.

Alice Gerrits, Gerald de Haan en collega’s zochten naar zogeheten ‘expression quantitative trait loci’ (eQTLs) in DNA op door verschillen in genetische expressie bij 25 verschillende labmuizenstamen te relateren aan verschillen in hun genoom. Per muis deden ze dat in 4 verschillende bloedcellen: totaal ongedifferentieerde stamcellen, rode bloedcellen, witte bloedcellen en cellen die al een eindje waren gedifferentieerd maar nog geen ‘keuze’ tutssen rood of wit hadden gemaakt.

Uiteindelijk vonden ze 365 eQTLs die in allevier de celtypen evenveel effect leken te hebben. Maar daar stonden er 1.283 tegenover die vooral van invloed waren op één van de vier typen.

bron: NWO