Craig Venter vist drie miljoen onbekende proteïnen uit de oceaan

Micro-organismen in de wereldzeeën maken minstens 6,12 miljoen verschillende eiwitsequenties aan. Dat zijn er bijna tweemaal zoveel dan tot nu toe werd gedacht, zo blijkt uit onderzoek van geneticus Craig Venter.

Volgens Venter, die beroemd werd door het menselijk genoom op te helderen, is het nog maar het topje van de ijsberg. “We hebben nog niet veel begrepen van onze eigen planeet en onze eigen omgeving: “Tot nu toe hebben we 99 procent van alle bestaande levensvormen en biologische processen gemist”, zo verklaart hij in MIT Technology Review.

Het onderzoeksteam van Venter heeft de proteïnen opgespoord door met een zeiljacht een tocht van bijna 10.000 kilometer rond het Amerikaanse continent te maken, van Halifax (Nova Scotia) naar Frans Polynesië. Op 37 plaatsen werd een watermonster genomen en al het daarin aanwezige DNA werd onderzocht.

De eerste resultaten zijn nu gepubliceerd in PLoS Biology. Er zijn 7,7 miljoen sequenties ontcijferd,. Voorspeld wordt dat ze coderen voor 6,12 miljoen proteïnen. waarvan bijna de helft n geen enkele databank voorkomt. Er zitten er een hoop tussen die sterk op elkaar lijken (bijvoorbeeld 9.000 varianten op glutaminesynthetase). Toch word gesproken van 1.700 tot nu toe onbekende eiwitfamilies.

bronnen: Venter Institute,Technology Review, The Scientist