Heeft STM-microscoop potentie als supersnelle sequenser?

Misschien kunnen DNA-volgordes ooit supersnel en spotgoedkoop worden bepaald door de complete streng base voor base af te tasten met de naald van een scanning tunneling microscoop (STM). Dat suggereert Stuart Lindsay (Arizona State University) op de website van Nature Nanotechnology.

Het basisidee is om een base (of iets dat er chemisch op lijkt) aan de tip van de STM te hangen en dan te kijken of die base aan de streng bindt. Gebeurt dat, dan weet je dat op die plek een complementaire base zit.

De feitelijke detectie maakt gebruik van quantumeffecten. Lindsay wil de ‘tunnelstroom’ meten, veroorzaakt door elektronen die als het ware overspringen wanneer je de basen voorzichtig weer van elkaar trekt. Bij de combinatie adenine-thymine moet je op dat moment 2 waterstofbruggen verbreken, bij cytosine-guanine zijn het er 3. In dat laatste geval doet de tunnelstroom er duidelijk langer over om weg te ebben.

Uiteraard zal het nog wel even duren eer dit principe praktisch toepasbaar is.

bron: Arizona State Unversity